Після обробки волоски насіння бавовнику використовують у медицині під назвою вата (лат. Gossypium). З насіння бавовнику одержують напіввисихаюча жирна бавовняна олія (Oleum Gossypii), що вживається в їжу, рідше у фармації.
Бавовник – одна з найважливіших прядильних культур у світі. Його волокно є сировиною для текстильної промисловості. Олія, одержувана з насіння, використовують у їжу, а макуха – як високобілковий корм для худоби. З 1 т бавовни-сирцю отримують 320 – 340 кг волокна та 560 – 680 кг насіння.
З бавовни виробляють тканини, трикотаж, нитки, вату та інше. Пух та подпушек бавовни застосовують у хімічній промисловості як сировину для виготовлення штучного волокна та ниток, плівки, лаків тощо. Його використовують у вибухових речовинах.
Бавовняне насіння займає друге місце у світі після сої як сировину для отримання рослинної олії: її вихід становить 16% ваги насіння. Крім того, із насіння бавовнику отримують борошно (45%), лінт (9%) та макуха (26%); на відходи залишається лише 4%.